年，希望组合作项目好文不断，截止年4月，希望组基于三代测序技术的基因组、转录组项目文章已发表17篇，其中不乏NatureGenetics、NaturePlants等高分文章。今天组学君就给大家盘点一下植物方向部分案例文章，为大家解锁发文经典套路！
高质量基因组揭示棉花A亚基因组起源[1]
GenomesequenceofGossypiumherbaceumandgenomeupdatesofGossypiumarboreumandGossypiumhirsutumprovideinsightsintocottonA-genomeevolution
合作单位：武汉大学高等研究院
发表期刊：NatureGenetics
影响因子：25.
发表日期：.04.13
三代测序平台：PacBioRSIISequel
异源四倍体棉花A亚基因组和D亚基因组的起源一直是科学家想要回答的问题，目前学界公认D亚基因组的供体为雷德蒙氏棉D5，但是A亚基因组的起源仍存在争议，没有确切证据支持其来源于非洲棉A1或亚洲棉A2。本研究利用三代测序技术组装了首个草棉基因组（var.Africanum，A1,n=x=13），并对亚洲棉和陆地棉基因组进行了更新。通过比较基因组分析、基因组进化及群体遗传分析，理清了非洲棉A1、亚洲棉A2和A亚基因组之间的进化关系：A亚基因组与非洲棉A1、亚洲棉A2有着共同的祖先A0（已灭绝），在约1.0?1.6百万年前A0与雷德蒙氏棉D5形成异源四倍体棉花AD，约70万年前A0分化出非洲棉A1与亚洲棉A2（图1）。这一模型的提出结束了许久以来异源四倍体棉花A亚基因组起源的争议，为棉属研究提供了重要理论指导和遗传资源，加快了棉花主要农艺性状的遗传改良进程。
图1棉花A基因组起源与进化模型（a）和重要进化事件（b）
ONT测序助力攻克首个高质量角苔参考基因组[2]
Thehornwortgenomeandearlylandplantevolution
合作单位：中国科学院植物研究所、福建农林大学、深圳仙湖植物园、比利时根特大学
发表期刊：NaturePlants
影响因子：13.
发表日期：.02.10
三代测序平台：NanoporePromethION
苔藓类包括苔、藓和角苔三大分支，是现存最早的陆生植物，在植物演化过程中代表从水生到陆生的过渡类型。角苔类以其难解的系统位置、独特的形态特征、以及其与细菌、真菌广泛共生的特异现象而备受
